As matrizes de referência são documentos que contêm questões de auditoria ou pontos de controle constantes, os quais deverão ser examinados em processos de fiscalização específicos.

A publicação das matrizes de referências tem como objetivo dar conhecimento, às unidades administrativas do Tribunal, dos critérios utilizados pela Secretaria de Auditoria na fiscalização de determinados objetos, visando ao aperfeiçoamento dos controles internos administrativos dessas unidades.